Με καθυστέρηση περίπου δύο ωρών αναχώρησε τελικά το Νήσος Σάμος από το λιμάνι του Πειραιά την Τετάρτη 27 Δεκεμβρίου. Οι λιμενικές αρχές προχώρησαν σε έλεγχο του πλοίου μετά από ανώνυμο τηλεφώνημα που ανέφερε πως είχε τοποθετηθεί σε αυτό βόμβας. Οι έρευνες ολοκληρώθηκαν λίγο μετά τις 21:30, όταν και έληξε ο συναγερμός και ο κόσμος επιστρέφει στο πλοίο το οποίο θα αναχωρήσει για τον προορισμό του με καθυστέρηση.